提交 · 0.0.7a · HPCSource / alphafold2

该项目从 https://github.com/lucidrains/alphafold2 镜像。拉取镜像更新于 31分钟前。

2月 03, 2021
- fix CUDA with MDS · 8fc6d12b
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  0.0.7a
  
  8fc6d12b
- readme · 5f9355bd
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  0.0.7
  
  5f9355bd
- fix tests · 513de1ad
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  513de1ad
- fix readme · 2da19ddd
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  2da19ddd
- Delete python-package.yaml · f4e15b9b
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  f4e15b9b
- Create python-package.yml · 584d6c3d
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  584d6c3d
- Merge pull request #24 from lucidrains/pw/cleanup-utils · 6dbbeb44
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
move utils into package
```
  6dbbeb44
- move utils into package · bdd10ead
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  bdd10ead
- Merge pull request #23 from lucidrains/pw/cleanup-utils · bae547d1
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
cleaning up utils
```
  bae547d1
- make test pass, even if output dimensions seem fishy · d7586d05
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  d7586d05
- keep cleaning · 42a32603
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  42a32603
- more cleanup · 56ddabaa
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  56ddabaa
- add new github action for testing · 464ff780
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  464ff780
- prepare testing scaffold · b9a8b110
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  b9a8b110
- cleaning up utils · 699730d8
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  699730d8
- make sure SE3Transformer is imported · c9a636a4
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  c9a636a4
- Update setup.py · cf5173f9
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  0.0.6
  
  cf5173f9
- Merge pull request #22 from hypnopump/main · 08340a27
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
Fixes esm model name, Adds se3 , wrapper for sidechain, input elongation
```
  08340a27
- adds naive atom tokens for refinement but should work · caf089c0
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  caf089c0
- input elongations · 3a6a8f06
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  3a6a8f06
- fix simple unpacking · 08583b52
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  08583b52
- incorporates se3 in train_e2e, scaffld for sidechain · 50d1d921
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  50d1d921
2月 01, 2021
- readme · 6c353cc5
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  6c353cc5
- add presentation link · 7c6de310
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  7c6de310
- Merge pull request #20 from hypnopump/main · 79435d75
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
Adds point cloud utils
```
  79435d75
1月 31, 2021
- remove old lines · 7ec08018
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  7ec08018
- solving inconsistency. still not ready for sidechains · 10ca9097
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  10ca9097
- adding point cloud utils. better code org (esm, msa, ...) · 50fb7457
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  50fb7457
1月 30, 2021
- credit assignment · f1ad5271
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  f1ad5271
- Merge pull request #19 from hypnopump/main · 3a937275
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
Add attn embedding
```
  3a937275
- add attn as potential replacement for msa · 5c5af15b
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  5c5af15b
- Merge https://github.com/lucidrains/alphafold2 into main · 67db7d97
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  67db7d97
- readme · f0f7b210
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  f0f7b210
1月 24, 2021
- readme · 73771d95
  由 Phil Wang 创作于 4年前
  
  73771d95
1月 22, 2021
- adding general device naming. cuda is recommended · 62557633
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  62557633
1月 21, 2021
- Merge pull request #18 from hypnopump/main · d4b9946c
  由 Phil Wang 创作于 4年前
```
Solves searchsorted shape issues
```
  d4b9946c
- stupid max/min typo · ec4a2b2e
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  ec4a2b2e
- supports batched predictions again · e149ea8b
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  e149ea8b
- center_distogram does not support batched preds · 93be3f9e
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  93be3f9e
- ensures same device · 699fbf95
  由 hypnopump 创作于 4年前
  
  699fbf95