Skip to content
GitLab
探索
登录
主导航
搜索或转到…
项目
S
salmon
管理
动态
成员
标记
计划
议题
0
议题看板
里程碑
迭代
Wiki
代码
合并请求
0
仓库
分支
提交
标签
仓库图
比较修订版本
代码片段
锁定的文件
构建
流水线
作业
流水线计划
产物
部署
发布
软件包库
运维
环境
Terraform 模块
监控
事件
服务台
分析
价值流分析
Contributor analytics
CI/CD 分析
仓库分析
代码评审分析
议题分析
模型实验
帮助
帮助
支持
GitLab 文档
比较 GitLab 各版本
社区论坛
为极狐GitLab 提交贡献
提交反馈
快捷键
?
支持
扫描加入微信群:
1. 获取企业级DevOps解决方案支持
2. 免费或折扣极狐GitLab 官方培训认证
代码片段
群组
项目
HPCSource
salmon
提交
167b4945
提交
167b4945
编辑于
5年前
作者:
k3yavi
浏览文件
操作
下载
补丁
差异文件
fixing mtx bug
上级
179191a0
分支
分支 包含提交
标签
v0.14.2
无相关合并请求
变更
1
隐藏空白变更内容
行内
左右并排
显示
1 个更改的文件
src/CollapsedCellOptimizer.cpp
+7
-7
7 个添加, 7 个删除
src/CollapsedCellOptimizer.cpp
有
7 个添加
和
7 个删除
src/CollapsedCellOptimizer.cpp
+
7
−
7
浏览文件 @
167b4945
...
...
@@ -437,12 +437,6 @@ void optimizeCell(std::vector<std::string>& trueBarcodes,
<<
"
\t
"
<<
totalExpGenes
<<
"
\t
"
<<
numGenesOverMean
;
if
(
dumpUmiGraph
)
{
featuresStream
<<
arboString
.
rdbuf
();
}
else
{
featuresStream
<<
"
\t
"
<<
averageNumMolPerArbo
;
}
if
(
mRnaGenes
.
size
()
>
1
)
{
featureCode
+=
1
;
featuresStream
<<
"
\t
"
<<
mitoCount
/
totalUmiCount
;
...
...
@@ -453,6 +447,12 @@ void optimizeCell(std::vector<std::string>& trueBarcodes,
featuresStream
<<
"
\t
"
<<
riboCount
/
totalUmiCount
;
}
if
(
dumpUmiGraph
)
{
featuresStream
<<
arboString
.
rdbuf
();
}
else
{
featuresStream
<<
"
\t
"
<<
averageNumMolPerArbo
;
}
features
=
featuresStream
.
str
();
}
// end making features
...
...
@@ -788,7 +788,7 @@ bool CollapsedCellOptimizer::optimize(EqMapT& fullEqMap,
};
uint32_t
zerod_cells
{
0
};
size_t
numFlags
=
(
numGenes
/
8
)
+
1
;
size_t
numFlags
=
std
::
ceil
(
numGenes
/
8
);
std
::
vector
<
uint8_t
>
alphasFlag
(
numFlags
,
0
);
size_t
flagSize
=
sizeof
(
decltype
(
alphasFlag
)
::
value_type
);
...
...
This diff is collapsed.
Click to expand it.
预览
0%
请重试
或
添加新附件
.
取消
You are about to add
0
people
to the discussion. Proceed with caution.
先完成此消息的编辑!
保存评论
取消
想要评论请
注册
或
登录